POY

Описание

POY — это программа филогенетического анализа, которая поддерживает несколько типов данных (например, морфологию, нуклеотиды, гены и области генов, хромосомы и целые геномы). POY отличается тем, что он может выполнять истинное выравнивание и вывод о филогении, т. Е. Входные последовательности не нужно предварительно выравнивать. Затем вставки, удаления и перестановки могут быть включены в общую оценку дерева в разделе «Максимальная экономия» или в модель в разделе «Максимальное правдоподобие». Для этой цели были разработаны различные эвристические алгоритмы, которые реализованы в POY.