MD simulation for iPhone

Описание

Университет Ульсана, Школа машиностроения, Лаборатория MNTF (микро/наномасштабная инженерия терможидкостей). http://home2.ulsan.ac.kr/user/nanofluid/Пожалуйста, следуйте инструкциям ниже для нескольких примеров. Все приведенные ниже примеры предполагают начальные состояния после экрана загрузки. (отрегулируйте Dt, чтобы увидеть результат быстрее. Также попробуйте с [WCA] и [Ideal]) 1. Моделирование течения Куэтта [Старт] - дождитесь, пока система не достигнет равновесия- [Куэтт] - подождите, пока система не достигнет установившееся состояние (профили мгновенной скорости доступны в сером прямоугольнике справа внизу) 2. Моделирование течения Пуазейля [Старт] — дождаться, пока система не достигнет равновесия — [Пуазейль] — дождаться, пока система не достигнет установившегося состояния 3. Диффузия моделирование [Init3,4,5] - установить целевую температуру около 250~350K - [старт] 4. Моделирование замораживания и кристаллизации [Init3,4,5] - установить целевую температуру ниже 80K - [старт] 5. Дополнительные советы! Кнопка [Старт] задает распределение скоростей Максвелла-Больцмана для каждой молекулы жидкости. ! [L-J] относится к потенциалу VDW, основанному на молекулярном параметре аргона, [WCA] представляет собой чисто отталкивающее межмолекулярное взаимодействие, а [Ideal] не учитывает размер молекул и столкновения, как предполагает закон идеального газа. ! Вы можете увеличить временной шаг (Dt), чтобы ускорить симуляции, но это может привести к сбою симуляций и сбросу. ! Когда симуляция сбрасывается, целевая температура и временной шаг (Dt) устанавливаются на минимально возможное значение. ! Вы можете изменить целевую температуру во время моделирования и отрегулировать текущую температуру с помощью термостата. ! Вы можете запустить моделирование в различных начальных условиях, используя кнопку [Init]! Кнопка [T/Tt] устанавливает термостат в систему с заданной температурой. Метка «КРАСНЫЙ» означает термостат масштабирования скорости, а метка «ОРАНЖЕВЫЙ» означает термостат Nose-Hoover. ***Молекулярная динамика в iPhone Argon Fluid в 5-нм канале. За последние два десятилетия революционное развитие высокопроизводительных вычислительных ресурсов возглавило исследования молекулярной динамики (МД) моделирования атомарного уровня в персональных настольных компьютерах. Сейчас я расширяю платформы МД до доступных мощных мобильных вычислительных устройств (iPhone), и это может быть первая попытка в истории МД. Потоки жидкости в микронных и наноразмерных областях часто встречаются в компонентах микроэлектромеханических систем, микрофлюидных устройств и в жестких дисках компьютеров. Например, для систем с жесткими дисками расстояние между головкой и носителем составляет порядка десятков нанометров. Течение жидкости в таких малых масштабах нельзя описать с помощью гипотезы континуума. Молекулярная динамика потенциально может решить такие проблемы, как интерфейсы/взаимодействия между твердым телом и жидкостью, возникающие в наномасштабном режиме. Кроме того, крупномасштабное моделирование, основанное на атомистических моделях, может также учитывать переход от атомистических подходов к непрерывному масштабу. Это код молекулярной динамики (МД) (i2DMD), работающий на iPhone. Этот код имеет большинство функций (но упрощен для визуализации и образовательных целей) фактического кода MD, используемого для моих публикаций в журналах SCI, перечисленных в информационной ссылке. Вы можете моделировать течение Куэтта, течение Пуазейля, диффузию и замерзание аргона в 5-нм канале с периодическими граничными условиями. Я надеюсь, что этот пример кода поможет людям понять наноразмерные молекулярные