MultiGeneBlast

Описание

MultiGeneBlast - это инструмент с открытым исходным кодом, основанный на переформатировании заголовков FASTA записей белков NCBI GenBank, с помощью которого он может отслеживать их исходный нуклеотид и координаты. MultiGeneBlast может помочь в обнаружении таких мультигенных частей для проектов синтетической биологии. Синтетическая библиотека оперонов может быть создана на основе ее выходных данных для определения тех оперонов, функция которых наиболее близка к желаемой пользователем. Этот инструмент предоставляет возможности для идентификации всех гомологичных геномных регионов путем объединения результатов отдельных прогонов BlastP для каждого гена и сортировки геномных регионов из любой записи GenBank по количеству совпадений, сохранности синтении и совокупной битовой оценке Blast. Можно выполнить поиск по архитектуре, чтобы найти любые геномные области с попаданием Blast в любую указанную пользователем комбинацию аминокислотных последовательностей.