| Версия | 1.01 |
|---|---|
| Издатель | Paul A. Wilson |
| Дата выпуска | 25 авг. 2008 г. |
| Дата добавления | 11 авг. 2004 г. |
| Требования ОС | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Требования | Mac OS X 10.3 |
| Всего скачиваний | 29 |
| Цена | Free |
Описание
Инструмент командной строки для сравнения файлов данных с разделителями-запятыми с использованием относительных различий для определения наиболее похожих конформаций. Compsort сравнивает файлы данных, используя относительную разницу, вычисляет оценку сходства, сортирует оценки в порядке возрастания (более низкие значения представляют большее сходство), сохраняет X низких оценок.
Файлы данных, создаваемые пользователем, должны быть текстовыми файлами с разделителями-запятыми. Каждый файл представляет собой уникальную молекулу. Каждая строка в файле представляет собой уникальную конформацию молекулы. Первый столбец в файле данных должен быть меткой, уникальной для конформации, представленной строкой. Остальные столбцы представляют собой числовые дескрипторы, такие как измерения расстояния в пространстве.
Строки сравниваются комбинаторно между файлами. Сравниваемые метки объединяются и сохраняются вместе с оценками для набора строк. Это обеспечивает способ идентификации конформаций, которые дали заданную оценку сходства.
Будущая работа включает в себя:
добавление графического интерфейса
публикация статьи о моем алгоритме трехмерного моделирования фармакофора
Параллельная версия с использованием MPI
